本州（中国山地）産のニホンイノシシのデータによれば、雄の成体は頭胴長110～160cm 、体重 50～150kg、肩高 60～80cm 程度となります。雌は雄ほど大きくなりません。犬歯はよく発達して終生成長を続け、特に雄では牙となります。繁殖期は春～秋で．通常1 年に 1 回出産しますが，春と秋に 2 回出産することもあります。 1 回に 3～8 頭の子を産みます。雑食性で、植物の根や堅果、また小動物などさまざまなものを食べます。

イノブタはイノシシと家畜ブタをかけ合わせたものです。

渡嘉敷島では、在来種が捕食されていることが確認されています。渡嘉敷島にしか生息しないカクレサワガニ・トカシキミナミサワガニ・トカシキオオサワガニといった絶滅危惧種のサワガニ類が、イノシシの捕食被害を受けています。渡嘉敷島で捕獲されたイノシシの胃内容物より、トカシキオオサワガニ、ケラマサワガニなどのサワガニ類が比較的高い頻度（2割以上）で発見されています。

また、慶良間諸島では、ウミガメの卵が捕食されていることがわかっています（安里・松本 2018）。渡嘉敷島での 2016 年度の調査により，ウミガメ類の産卵巣の 51～78% がイノシシの食害を受けていることがわかりました。また、座間味島のニタ浜では、2019年度の調査でアオウミガメの産卵巣99のうち 95 巣（同 90 ％以上）が食害を受けました。

渡嘉敷島で捕獲された個体の胃内容物より、ミミズ類・セミ類等の土壌動物、カエル類・ヘビ類、また植物の根や球根が確認されており、カメ類の甲が含まれたとの情報もあります。その他にも、ユリ類の球根・クワズイモ・アダンの幹の芯を摂食しているとの情報が得られています。それ以外にも、ホルストガエルの繁殖地である水場環境をイノシシがヌタ場として使用し、環境を改変しているおそれがあります。

慶良間諸島において予想される生態系への影響として、イボイモリ・シリケンイモリ・ホルストガエル・リュウキュウヤマガメ・ハブ・アジサシ類など海鳥の卵や雛・イトスナズル・イゼナガヤの捕食が専門家により挙げられています。また、イノシシ由来の可能性のあるマダニ類のアカマタへの寄生、イノシシの接近などによるアジサシ類など海鳥の営巣妨害、あるいは掘り返しなどによって種子や稚樹などが影響を受け、植物群落の更新が停滞するといった間接的影響の可能性も指摘されています（沖縄県環境部 2018）。

石垣島・西表島には在来種のリュウキュウイノシシが生息しており、イノブタが交雑することで、イノブタの遺伝子がリュウキュウイノシシ集団内に広がる可能性があります。

慶良間諸島では、ジャガイモ・タイモ・サツマイモ（カンショ）・イネ等の農作物への食害が生じています。

沖縄県では2018年度から慶良間諸島のニホンイノシシ対策に取り組んでおり、2019年度から座間味島、2020年度から渡嘉敷島において試験捕獲を開始しています。渡嘉敷島では、渡嘉敷村の事業を含めて年間100頭前後が捕獲される状況が10年以上続いていますが、イノシシの個体数が減少するまでには至っていません。沖縄県では渡嘉敷島と座間味島において、自動撮影カメラを用いて捕獲効果のモニタリングを行うとともに、より効率的なイノシシの捕獲方法について検討を進めています。